From 877c71c1b6e35a7a94b70899fb59d960f0f68145 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: taschi Date: Sun, 22 Nov 2015 12:21:30 +0100 Subject: [PATCH] Hl7 Datei geupdatet --- src/main/java/de/uniluebeck/mi/projmi6/HL7.java | 244 +++++++++++++++++++----- 1 file changed, 191 insertions(+), 53 deletions(-) diff --git a/src/main/java/de/uniluebeck/mi/projmi6/HL7.java b/src/main/java/de/uniluebeck/mi/projmi6/HL7.java index 0e30f21..c513c38 100644 --- a/src/main/java/de/uniluebeck/mi/projmi6/HL7.java +++ b/src/main/java/de/uniluebeck/mi/projmi6/HL7.java @@ -5,38 +5,46 @@ import ca.uhn.hl7v2.HL7Exception; import ca.uhn.hl7v2.HapiContext; import ca.uhn.hl7v2.model.DataTypeException; import ca.uhn.hl7v2.model.Message; -import ca.uhn.hl7v2.model.v25.datatype.DTM; -import ca.uhn.hl7v2.model.v251.datatype.FN; +import ca.uhn.hl7v2.model.v251.group.BAR_P05_PROCEDURE; +import ca.uhn.hl7v2.model.v251.group.BAR_P05_VISIT; import ca.uhn.hl7v2.model.v251.message.ADT_A01; import ca.uhn.hl7v2.model.v251.message.BAR_P05; import ca.uhn.hl7v2.model.v251.segment.*; import ca.uhn.hl7v2.parser.Parser; -import de.uniluebeck.mi.projmi6.model.Diagnose; -import de.uniluebeck.mi.projmi6.model.Fall; -import de.uniluebeck.mi.projmi6.model.Patient; +import ca.uhn.hl7v2.parser.PipeParser; +import ca.uhn.hl7v2.validation.ValidationContext; +import ca.uhn.hl7v2.validation.impl.ValidationContextFactory; +import de.uniluebeck.mi.projmi6.model.*; +import java.io.BufferedWriter; +import java.io.File; +import java.io.FileWriter; import java.io.IOException; -import java.sql.Time; +import java.sql.SQLException; import java.time.LocalDate; import java.time.LocalDateTime; import java.time.LocalTime; import java.util.ArrayList; import java.util.List; +import static de.uniluebeck.mi.projmi6.db.DBHandler.getDiagnosenByFall; +import static de.uniluebeck.mi.projmi6.db.DBHandler.getPatient; + /** * Created by taschi on 15.11.15. * enthaelt alle Klassen um eine Hl7 Nachricht zu erstellen bzw. zu Parsen. */ public class HL7 { + + /** * erstellt eine ADT_A0 nachricht, welche anschließend an die OPS Gruppe verschickt werden soll. * TODO Mit OPS Gruppe absprechen, welche Informationen sie auf jeden Fall benötigen und Code entsprechend anpassen. * @param fall nach dem Erstellen eines neuen Falls wird diese Methode aufgerufen um Hl7 Nachricht zu erzeugen - * @param diagnosen Liste aller Nebendiagnosen momentan noch als einzelne Liste uebereben. eventuell die Nebendiagnosen direkt im Fall speichern? * @throws Exception */ - public void createMessageADTA01( Fall fall, List diagnosen) throws HL7Exception, IOException { + public void createMessageADTA01( Fall fall) throws HL7Exception, IOException, SQLException { Patient patient = fall.getPatient (); ADT_A01 adt = new ADT_A01 (); @@ -78,79 +86,209 @@ public class HL7 { pidSegment.getPid13_PhoneNumberHome (0).getTelephoneNumber ().setValue ( patient.getTelefon () ); pidSegment.getPid16_MaritalStatus ().getAlternateIdentifier ().setValue ( patient.getFamilienstand ().toString()); - //Dg1 (Diagnosen) - List dg1List = new ArrayList<> ( ); + //Diagnosen + List diagnosen = getDiagnosenByFall ( fall ); diagnosen.add(fall.getHauptDiagnose ()); - DG1 dg1Segment = adt.getDG1 (); - - for (Diagnose aDiagnosen : diagnosen) { - dg1Segment = adt.getDG1 (); - dg1Segment.getDg12_DiagnosisCodingMethod ().setValue ( "ICD10" ); - dg1Segment.getDg13_DiagnosisCodeDG1 ().getIdentifier ().setValue ( "CODE" ); - dg1Segment.getDg14_DiagnosisDescription ().setValue ( aDiagnosen.getFreiText () ); - dg1List.add ( dg1Segment ); + if(!diagnosen.isEmpty ()) { + for (Diagnose diagnose : diagnosen) { + DG1 dg1Segment = adt.getDG1 (); + dg1Segment.getDg13_DiagnosisCodeDG1 ().getIdentifier ().parse ( diagnose.getIcd10code ().getCode () ); + dg1Segment.getDg16_DiagnosisType ().setValue ( String.valueOf ( diagnose.getIcd10code ().getVersion () ) ); + dg1Segment.getDg116_DiagnosingClinician ()[0].parse ( diagnose.getArzt ().toString () ); + dg1Segment.getDg14_DiagnosisDescription ().parse ( diagnose.getFreiText () ); + dg1Segment.getDg16_DiagnosisType ().parse ( diagnose.getDiagArt ().toString () ); + adt.getDG1All ().add ( dg1Segment ); + } } - //print generated message - // printXMLEncodedMessageADT(adt); - } + printXMLEncodedMessageADT(adt); - /** - * gibt erzeugte hl7 Nachricht auf der Konsole aus (Kann nach Debug phase wieder geloescht werden) - * @param msg - * @throws HL7Exception - */ - public void printXMLEncodedMessageADT(Message msg) throws HL7Exception { - HapiContext context = new DefaultHapiContext (); - Parser parser = context.getXMLParser(); - String encodedMessage = parser.encode (msg); - System.out.println (encodedMessage); } /** * * @param msg */ - public void parseMessage(Message msg) throws DataTypeException { + public void parseMessage(Message msg) throws HL7Exception, SQLException { if (msg instanceof BAR_P05) { BAR_P05 p05 = (BAR_P05) msg; - Patient patient = new Patient(); - Fall fall = new Fall(); - EVN evnSegment = p05.getEVN (); - LocalDateTime ldt = generateLocalDateTimeFromHl7(p05); - patient.setBearbeitetDatumZeit(ldt); - //patient.setBearbeiter(evnSegment.getEvn5_OperatorID(0).getIDNumber()); PID pidSegment = p05.getPID(); - patient.setPatID(Integer.valueOf(pidSegment.getPid3_PatientIdentifierList(0).getIDNumber().getValue()));//evt das 4. Segment - patient.setNachname(pidSegment.getPid5_PatientName(0).getFamilyName().getName()); - patient.setVorname(pidSegment.getPid5_PatientName(0).getGivenName().getValue()); - ca.uhn.hl7v2.model.v251.datatype.DTM geburtsTag = pidSegment.getPid7_DateTimeOfBirth().getTime(); - LocalDate ld = LocalDate.of(geburtsTag.getYear(),geburtsTag.getMonth(),geburtsTag.getDay()); - patient.setGeburtsdatum(ld); - // patient.setGeschlecht(pidSegment.getPid8_AdministrativeSex().getValue()); + EVN evnSegment = p05.getEVN (); + Patient patient; + Fall fall; + Station station; + StationsHistorie statHist; + List diagnosenP05 = new ArrayList<> ( ); + List untersuchungenP05 = new ArrayList<> ( ); + List visitList = p05.getVISITAll (); + int pid = Integer.valueOf(pidSegment.getPid3_PatientIdentifierList(0).getIDNumber().encode ());//evt das 4. Segment ? + if (getPatient(pid) != null) { + patient = getPatient(pid); + //TODO wie bekommen wir hier den aktuellen Fall ? + fall = null; + List diagnosenKIS; + //TODO dbHandler query getDiagnosen by FallID um herauszufinden ob DIagnose geupdatet werden soll oder neu erzeugt + List untersuchungenKIS; + } else { + //neuen Patienten anlegen + patient = new Patient (); + fall = new Fall(); + fall.setPatient ( patient ); + patient.setPatID(Integer.valueOf(pidSegment.getPid3_PatientIdentifierList(0).getIDNumber().encode ()));//evt das 4. Segment + patient.setNachname(pidSegment.getPid5_PatientName(0).getFamilyName().encode ()); + patient.setVorname(pidSegment.getPid5_PatientName(0).getGivenName().encode ()); + ca.uhn.hl7v2.model.v251.datatype.DTM geburtsTag = pidSegment.getPid7_DateTimeOfBirth().getTime(); + LocalDate ld = LocalDate.of(geburtsTag.getYear(),geburtsTag.getMonth(),geburtsTag.getDay()); + patient.setGeburtsdatum(ld); + //TODO funktion in den Enums anlegen + // patient.setGeschlecht(pidSegment.getPid8_AdministrativeSex().getValue()); + //patient.setFamilienstand(); + //TODO patient in datenbank neu anlegen + } + //Stationshistorie aktualisieren + for (BAR_P05_VISIT visit: visitList) { + PV1 pv1Segment =visit.getPV1 (); + if(stationExists()) { + //TODO getStationshistorie + statHist = new StationsHistorie (); + } else { + station = new Station(); + station.setStation ( pv1Segment.getPv13_AssignedPatientLocation ().getPointOfCare ().encode () ); + station.setAbteilung ( pv1Segment.getPv13_AssignedPatientLocation ().getFacility ().encode () ); + statHist = new StationsHistorie (); + statHist.setStation ( station ); + } + statHist.setFallID ( fall.getFallID () ); + statHist.setAufnahmeDatum (generateLocalDateTimeFromHl7(pv1Segment.getPv144_AdmitDateTime ().getTime ()) ); + statHist.setEntlassungsDatum(generateLocalDateTimeFromHl7(pv1Segment.getPv145_DischargeDateTime ()[0].getTime ())); + + + + //Untersuchungen + List procedureList = visit.getPROCEDUREAll(); + for (BAR_P05_PROCEDURE procedure : procedureList) { + PR1 pr1Segment = procedure.getPR1(); + Untersuchung untersuchung = new Untersuchung(); + + OpsCode opscode = new OpsCode(pr1Segment.getPr13_ProcedureCode ().encode (), "", Integer.valueOf ( pr1Segment.getProcedureDescription ().getVersion ())); + untersuchung.setOpscode(opscode); + untersuchung.setUntersuchungsdatum(generateLocalDateTimeFromHl7 (pr1Segment.getProcedureDateTime().getTime())); + untersuchung.setFall(fall); + + //TODO dbHandler query was genau ist die untersID? + String einweisenderarzt = pr1Segment.getPr112_ProcedurePractitioner(0).encode(); + untersuchung.setDurchfuehrenderArzt(new Mitarbeiter(0)); + + untersuchungenP05.add(untersuchung); + } + + // Diagnosen + List dg1Segmente = visit.getDG1All (); + for ( DG1 dg1Segment : dg1Segmente) { + Icd10Code icd10code; + if(icd10CodeExists ()) { + //TODO get icd Code + icd10code = null; + } else { + icd10code = new Icd10Code(dg1Segment.getDg13_DiagnosisCodeDG1 ().getIdentifier().encode(), "", Integer.valueOf ( dg1Segment.getDg16_DiagnosisType ().getVersion ())); + + } + + String einweisenderArzt = dg1Segment.getDg116_DiagnosingClinician ()[0].encode (); + //TODO dbHandler query + + Mitarbeiter mitarbeiter = new Mitarbeiter(0); + //TODO herausfinden ob diagnose bereits existiert + Diagnose diagnose = new Diagnose(); + diagnose.setIcd10code(icd10code); + diagnose.setArzt(mitarbeiter); + diagnose.setFall(fall); + diagnose.setFreiText ( dg1Segment.getDg14_DiagnosisDescription ().encode () ); + //TODO Diagnoseart + + diagnosenP05.add(diagnose); + } + + //ACK generieren aenderungen in db schreiben. + } + + + LocalDateTime ldt = generateLocalDateTimeFromHl7(evnSegment.getEventOccurred ().getTime ()); + patient.setBearbeitetDatumZeit(ldt); + patient.setBearbeiter(Integer.valueOf ( evnSegment.getEvn5_OperatorID(0).getIDNumber().encode ())); } } - public LocalDateTime generateLocalDateTimeFromHl7(BAR_P05 msg) throws DataTypeException { - EVN evnSegment = msg.getEVN(); + private boolean icd10CodeExists() { + return false; + } + private LocalDateTime generateLocalDateTimeFromHl7( ca.uhn.hl7v2.model.v251.datatype.DTM dtm) throws DataTypeException { + int stunden = dtm.getHour (); + int minuten = dtm.getMinute (); + int sekunden = dtm.getSecond (); + int jahr = dtm.getYear (); + int monat = dtm.getMonth (); + int tag = dtm.getDay (); - int stunden = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getHour (); - int minuten = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getMinute (); - int sekunden = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getSecond (); - int tag = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getDay (); - int monat = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getMonth (); - int jahr = evnSegment.getEvn2_RecordedDateTime ().getTime ().getYear (); LocalTime bearbeitetZeit = LocalTime.of(stunden,minuten,sekunden); LocalDate bearbeitetDate = LocalDate.of(jahr, monat, tag); LocalDateTime ldt = LocalDateTime.of(bearbeitetDate, bearbeitetZeit); return ldt; + } + + public boolean abteilungExists(String abteilungsID) { + return false; + } + public boolean stationExists() { + return false; + } + + + + /** + * gibt erzeugte hl7 Nachricht auf der Konsole aus (Kann nach Debug phase wieder geloescht werden) + * @param msg + * @throws HL7Exception + */ + public void printXMLEncodedMessageADT(Message msg) throws HL7Exception, IOException { + HapiContext context = new DefaultHapiContext (); + Parser parser = context.getXMLParser(); + String encodedMessage = parser.encode(msg); + LocalDateTime ldt = LocalDateTime.now(); + File file = new File("ADTA01Messafge" +LocalDateTime.now().toString() +"xml" ); + if (!file.exists()) { + file.createNewFile(); + } + FileWriter fw = new FileWriter(file.getAbsoluteFile()); + BufferedWriter bw = new BufferedWriter(fw); + bw.write(encodedMessage); + bw.close(); + System.out.println (encodedMessage); + } + + /** + * + * @param msg + */ + + public void validateMessage(Message msg) { + HapiContext context = new DefaultHapiContext(); + context.setValidationContext(ValidationContextFactory.defaultValidation()); + PipeParser parser = context.getPipeParser(); + try { + parser.encode(msg); + } catch (HL7Exception e) { + System.out.println("invaid message!" +e); + } } + + }